Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk1P41969 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk1P41969 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk1P41969 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk1P41969 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk1P41969 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms