Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox7P40646 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox7P40646 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox7P40646 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox7P40646 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox7P40646 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms