Protein–RNA interactions for Protein: P40645

Sox6, Transcription factor SOX-6, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox6P40645 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms