Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ThpoP40226 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ThpoP40226 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ThpoP40226 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms