Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf1P39428 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Traf1P39428 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Traf1P39428 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms