Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik2P39087 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms