Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpargP37238 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PpargP37238 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PpargP37238 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PpargP37238 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PpargP37238 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PpargP37238 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PpargP37238 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpargP37238 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpargP37238 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpargP37238 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PpargP37238 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpargP37238 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpargP37238 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpargP37238 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpargP37238 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpargP37238 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpargP37238 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpargP37238 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpargP37238 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpargP37238 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpargP37238 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms