Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TpoP35419 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TpoP35419 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TpoP35419 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TpoP35419 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpoP35419 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpoP35419 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpoP35419 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TpoP35419 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TpoP35419 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms