Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp4P35123 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp4P35123 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms