Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms