Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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