Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptk2P34152 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptk2P34152 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms