Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola1P33609 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola1P33609 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola1P33609 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola1P33609 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola1P33609 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pola1P33609 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola1P33609 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola1P33609 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pola1P33609 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms