Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms