Protein–RNA interactions for Protein: P32115

Pax4, Paired box protein Pax-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax4P32115 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax4P32115 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax4P32115 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms