Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms