Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp1P29452 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp1P29452 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp1P29452 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp1P29452 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms