Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pabpc1P29341 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms