Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms