Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms