Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms