Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-DMaP28078 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms