Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms