Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd40lgP27548 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms