Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms