Protein–RNA interactions for Protein: P26450

Pik3r1, Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3r1P26450 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pik3r1P26450 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3r1P26450 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms