Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChgaP26339 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChgaP26339 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChgaP26339 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChgaP26339 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChgaP26339 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChgaP26339 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms