Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms