Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ggta1P23336 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ggta1P23336 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ggta1P23336 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ggta1P23336 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggta1P23336 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggta1P23336 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggta1P23336 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ggta1P23336 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggta1P23336 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggta1P23336 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms