Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkchP23298 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkchP23298 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkchP23298 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkchP23298 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkchP23298 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkchP23298 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkchP23298 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkchP23298 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkchP23298 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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