Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PparaP23204 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PparaP23204 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PparaP23204 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PparaP23204 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PparaP23204 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PparaP23204 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PparaP23204 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PparaP23204 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PparaP23204 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PparaP23204 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PparaP23204 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PparaP23204 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PparaP23204 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PparaP23204 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PparaP23204 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PparaP23204 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PparaP23204 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PparaP23204 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PparaP23204 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PparaP23204 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PparaP23204 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PparaP23204 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PparaP23204 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PparaP23204 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PparaP23204 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PparaP23204 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PparaP23204 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PparaP23204 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PparaP23204 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PparaP23204 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PparaP23204 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PparaP23204 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PparaP23204 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PparaP23204 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PparaP23204 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PparaP23204 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PparaP23204 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PparaP23204 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PparaP23204 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PparaP23204 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PparaP23204 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PparaP23204 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PparaP23204 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PparaP23204 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PparaP23204 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PparaP23204 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PparaP23204 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PparaP23204 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PparaP23204 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PparaP23204 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PparaP23204 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PparaP23204 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PparaP23204 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PparaP23204 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PparaP23204 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PparaP23204 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PparaP23204 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PparaP23204 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PparaP23204 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms