Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou3f1P21952 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms