Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms