Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms