Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms