Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a1P19437 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a1P19437 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a1P19437 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms