Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NefhP19246 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NefhP19246 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NefhP19246 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NefhP19246 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NefhP19246 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NefhP19246 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NefhP19246 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NefhP19246 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NefhP19246 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NefhP19246 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NefhP19246 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NefhP19246 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NefhP19246 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NefhP19246 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NefhP19246 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NefhP19246 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NefhP19246 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NefhP19246 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NefhP19246 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NefhP19246 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NefhP19246 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NefhP19246 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NefhP19246 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NefhP19246 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NefhP19246 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NefhP19246 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NefhP19246 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NefhP19246 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NefhP19246 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NefhP19246 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NefhP19246 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NefhP19246 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NefhP19246 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NefhP19246 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NefhP19246 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NefhP19246 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NefhP19246 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NefhP19246 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NefhP19246 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NefhP19246 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms