Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms