Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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