Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcnaP17918 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PcnaP17918 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcnaP17918 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcnaP17918 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcnaP17918 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcnaP17918 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcnaP17918 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcnaP17918 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PcnaP17918 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms