Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms