Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Spi1P17433 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Spi1P17433 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Spi1P17433 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Spi1P17433 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Spi1P17433 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Spi1P17433 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Spi1P17433 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Spi1P17433 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Spi1P17433 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Spi1P17433 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Spi1P17433 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Spi1P17433 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spi1P17433 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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