Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgfb3P17125 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms