Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms