Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr1P16092 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms