Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkceP16054 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms