Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rag1P15919 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rag1P15919 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms