Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DmdP11531 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DmdP11531 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DmdP11531 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DmdP11531 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DmdP11531 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DmdP11531 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DmdP11531 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DmdP11531 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DmdP11531 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DmdP11531 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DmdP11531 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DmdP11531 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DmdP11531 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DmdP11531 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DmdP11531 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DmdP11531 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DmdP11531 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DmdP11531 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DmdP11531 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DmdP11531 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DmdP11531 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DmdP11531 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DmdP11531 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DmdP11531 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DmdP11531 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DmdP11531 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DmdP11531 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DmdP11531 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DmdP11531 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DmdP11531 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DmdP11531 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DmdP11531 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DmdP11531 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DmdP11531 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DmdP11531 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DmdP11531 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DmdP11531 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DmdP11531 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DmdP11531 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DmdP11531 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DmdP11531 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DmdP11531 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DmdP11531 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DmdP11531 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DmdP11531 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DmdP11531 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms