Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fv4P11370 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fv4P11370 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fv4P11370 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fv4P11370 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fv4P11370 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fv4P11370 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms