Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P10404 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P10404 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P10404 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P10404 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P10404 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P10404 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P10404 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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